Точных документальных сведений о возникновении Средней Ахтубы не сохранилось.
Легенда гласит, что в мае 1668 года Степан Разин со своими соратниками плыл в челне по весенней, широкой от половодья, реке Ахтубе и сделал остановку на высоком яру. Несколько его товарищей оставили атамана и поселились здесь навсегда. К ним постепенно присоединялись крестьяне, сбегавшие от помещиков в поисках лучшей доли.
Поселение назвали Нижним безродным городком. А улица, по которой 300 лет назад проходило русло полноводной Ахтубы, теперь называется улицей Степана Разина.
В 1758 году у реки проживало уже 3000 семей.
В 1773 году вольная жизнь переселенцев закончилась. Царское правительство повелело разводить тутовых червей для производства шёлка. Правда, из-за прожорливости червя, дело не пошло.
С 1810 года многие ахтубинцы попали в другую зависимость – стали перевозчиками соли с озера Эльтон. А с 1828 года их и вовсе определили государственными крестьянами, лишили льгот за шелководство и перевоз соли, обязали платить оброк.
В 1914 году село Средняя Ахтуба было уже большим населённым пунктом. Имелось 2 церкви, 2 школы, амбулатория, магазины, торговые лавки. Регулярно проводились ярмарки. Зажиточные крестьяне и купцы имели хорошие дома. Некоторые из них сохранились и до настоящего времени.
В 1928 году село переименовали в рабочий посёлок. Он стал центром образованного в это же время Среднеахтубинского района.